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壮族父系遗传历史研究(复旦大学 广西医科大学研究)(十)(请勿转载)

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土精灵

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发表于 2017-3-7 06:04:03 |只看该作者 |倒序浏览
(内部讨论文件,请勿转载)

2.6 广西壮族分支的Y染色体STR单倍群的网络分析


NRY中几个短串联重复(STR)的组合包含另一类型的Y染色体单倍群,其反映具有相同Y-SNP的不同群体中的微小遗传变异。这不同于Y-SNP单倍群,其仅可粗略地用于系统的系统发育分类。在基于Y-SNP信息分选不同壮族分支后,使用网络11.0Network 11.0)软件用来自所有分支个体的Y-STR数据绘制遗传网络以显示具有相同Y-SNP单倍群的分支之间的关系和差异。


如图7所示,单倍群O*STR网络的信息更加丰富,由于其在所有壮族分支中拥有更高的频率。红水河分支拥有O*单倍群的九个人中有8个拥有Y-STR,是所有分支中Y-STR频率最高的,其中三个被桂边,桂北和邕北的个体分享。另外,红水河壮族与其他单倍群密切相关,尤其是邕北和桂北个体,建立其在所有壮族分支中的中心位置。只有一个桂北个体与红水河分支共享相同的Y-STR单倍群,尽管桂北分支也有8STR单倍群在O*单倍群网络的边缘分布。更多的关联也在左江,右江和德靖分支被找到,其中,德靖作为一个封闭的群体,更加孤立于其他分支。总之,所有这些发现验证并支持主成分分析和上述聚类分析的结果。


同样,在O1网络中,红水河分支比其他分支具有更多的STR单倍型多态性,占据了框架的中心。然而,由于携带O2a单倍群的个体较少,它未能保持其在O2a中的领先地位,并让位于左江分支。在O3 *网络中没有共享的STR单倍群或任何显着差异。一个可能的解释是O3 *不是壮族的优势和特征单倍群。


4壮族北南分支,东西两组的AMOVA结果

  
组别
  
东部西部
北部-南部
东部: HSH, YN, YB, CL, GN
北部: YB, YJ, HB, HSH, GB
西部: ZJ, YJ, GB, E, DJ
南部: YN, ZJ, DJ, CL, E
人群间
17.851
3.461
人群内
18.539
32.929



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